| 1989 | Bruno Maderna interpreta Malipiero e Webern / Sergiu Celibidache interpreta Dallapiccola | Malipiero, Webern, Dallapiccola; Bruno Maderna, Sergiu Celibidache | | 1 |
| 1990 | Aubert: Sillages / Dukas/Roussel/Bartok/Schmitt/Malipiero/Goossens: Tombeau de Claude Debussy / Schmitt: Tombeau de Paul Dukas / Decaux: Clairs de lune | Louis Aubert, Paul Dukas, Albert Roussel, Béla Bartók, Florent Schmitt, G. Francesco Malipiero, Eugene Goossens, Abel Decaux; Marie-Catherine Girod | | 1 |
| 1990 | Concertos for Two Pianos and Orchestra | Martinu, Malipiero, Bartok; Janine Reding, Henry Piette | | 1 |
| 1991 | Respighi: Antiche danze ed arie per liuto, suite III / Wolf: Italienische Serenade / Malipiero: Rispetti e strambotti | Respighi, Wolf, Malipiero; I Solisti Italiani | | 4 |
| 1991 | The 8 String Quartets | Malipiero; Orpheus String Quartet | | 1 |
| 1992 | Il finto Arlecchino / Vivaldiana / Sette invenzioni / Quattro invenzioni | Gian Francesco Malipiero; Veneto Philharmonic Orchestra, Peter Maag | | 3 |
| 1993 | Symphonies nos. 3 and 4 / Sinfonia del mare | Gian Francesco Malipiero; Moscow Symphony Orchestra, Antonio de Almeida | | 2 |
| 1993 | Symphonies nos. 1 and 2 / Sinfonie del silenzio e della morte | Gian Francesco Malipiero; Moscow Symphony Orchestra, Antonio de Almeida | | 2 |
| 1993 | Symphony no. 7 "delle canzoni" / Sinfonia in un tempo / Sinfoa per Antigenida | Gian Francesco Malipiero; Moscow Symphony Orchestra, Antonio de Almeida | | 2 |
| 1994 | Symphonies nos. 5, 6, 8 & 11 | Gian Francesco Malipiero; Moscow Symphony Orchestra, Antonio de Almeida | | 2 |
| 1994 | Symphonies no. 9 "dell'ahimè" / no. 10 "Atropo / Sinfonia dello Zodiaco | Gian Francesco Malipiero; Moscow Symphony Orchestra, Antonio de Almeida | | 2 |
| 1995 | Italian Compositions of the 20th Century | Rota, Malipiero, Porena, Morricone; I Solisti Italiani | | 3 |
| 1995 | The Glory of Music in Venice | Maderna, Malipiero, Wolf-Ferrari, Galuppi, Albinoni, Vivaldi, G. Gabrieli; I Solisti Italiani | | 3 |
| 1995 | Manuel de Falla / Gian Francesco Malipiero | Manuel de Falla, Gian Francesco Malipiero; Nuccia Focile, Ingrid Surgenor, Dean Nixon, Bruno Maderna, Orchestra Sinfonica di Torino della RAI, Orchestra D. Scarlatti di Napoli della RAI | | 1 |
| 1996 | The String Quartets | Gian Francesco Malipiero; Quartetto d’archi di Venezia | | 1 |
| 2002 | I Dialoghi | Gian Francesco Malipiero | | 1 |
| 2003 | Malipiero / Debussy / Ravel / Shulman | Malipiero, Debussy, Ravel, Shulman; The Stuyvesant String Quartet, Benny Goodman | | 1 |
| 2007 | Piano Concertos 1-6 / Variazioni senza tema | Gian Francesco Malipiero; Sandro Ivo Bartoli, Rundfunk‐Sinfonieorchester Saarbrücken, Michele Carulli | | 1 |
| 2007 | String Quartets (complete) | Malipiero; Orpheus String Quartet | | 1 |
| 2011 | Impressioni dal vero / Pause del silenzio | Gian Francesco Malipiero; Orchestra sinfonica di Roma, Francesco La Vecchia | | 1 |
| 2014 | Fantasie di ogni giorno / Passacaglie / Concerti | Gian Francesco Malipiero; Orchestra sinfonica di Roma, Francesco La Vecchia | | 1 |
| 2018 | Violin Concertos | Gian Francesco Malipiero, Ferruccio Busoni; Domenico Nordio, Orchestra Sinfonica di Milano Giuseppe Verdi, Tito Ceccherini | | 1 |
| 2020 | Complete Piano Music, Vol. 1 | Gian Francesco Malipiero; Aldo Orvieto | | 2 |
| 2021 | Complete Piano Music, Vol. 2 | Gian Francesco Malipiero; Aldo Orvieto | | 1 |
| 2021 | Complete Songs for Soprano & Piano | Malipiero; Vansìsiem Lied Duo | | 1 |
| 2022 | Malipiero: Cello Concerto / Ghedini: L'Olmeneta | Gian Francesco Malipiero, Giorgio Federico Ghedini; Nikolay Shugaev; Dmitrii Prokofiev, Rostov Academic Symphony Orchestra, Valentin Uryupin | | 1 |
| 2022 | Violin Concertos nos. 1 and 2 / Per una favola cavalleresca | Gian Francesco Malipiero; Paolo Chiavacci, Orchestra sinfonica di Roma, Francesco La Vecchia | | 1 |
| 2023 | The String Quartets: Complete Edition | Gian Francesco Malipiero; Quartetto di Venezia | | 1 |
