| 1999 | Così fan tutte | Mozart; Véronique Gens, Bernarda Fink, Werner Güra, Marcel Boone, Pietro Spagnoli, Graciela Oddone, Concerto Köln, René Jacobs | | 1 |
| 1999 | Matthäus‐Passion | J.S. Bach; Collegium Vocale Gent, Philippe Herreweghe, Ian Bostridge, Franz-Josef Selig, Sibylla Rubens, Andreas Scholl, Werner Güra, Dietrich Henschel | 5 | 3 |
| 1999 | Così fan tutte | Wolfgang Amadeus Mozart; Graciela Oddone, Pietro Spagnoli, Marcel Boone, Werner Güra, Bernarda Fink, Véronique Gens, Concerto Köln, René Jacobs | | 1 |
| 1999 | Nachtgesang | Franz Schubert; Birgit Remmert, Werner Güra, Philip Mayers, Scharoun Ensemble, RIAS Kammerchor, Marcus Creed | | 1 |
| 2000 | Croesus | Reinhard Keiser; Akademie für Alte Musik Berlin, René Jacobs, Dorothea Röschmann, Werner Güra, Roman Trekel, Klaus Häger | | 1 |
| 2002 | Dichterliebe, op. 48 / Liederkreis, op. 39 | Schumann; Werner Güra, Jan Schultsz | | 2 |
| 2004 | Schöne Wiege meiner Leiden | Werner Güra & Christoph Berner | | 1 |
| 2005 | Lied | Bernarda Fink, Dietrich Henschel, Werner Güra | | 1 |
| 2007 | Schwanengesang | Franz Schubert; Werner Güra, Christoph Berner | | 1 |
| 2007 | Die schöne Müllerin | Franz Schubert; Werner Güra, Jan Schultsz | | 1 |
| 2007 | Liebeslieder-Walzer op. 52 & 65 | Johannes Brahms; Marlis Petersen, Stella Doufexis, Werner Güra, Konrad Jarnot, Christoph Berner, Camillo Radicke | | 1 |
| 2007 | Weihnachtsoratorium BWV 248 | Johann Sebastian Bach; Christine Schäfer, Bernarda Fink, Werner Güra, Gerald Finley, Christian Gerhaher, Arnold Schoenberg Chor, Concentus Musicus Wien, Nikolaus Harnoncourt | | 2 |
| 2010 | Die Winterreise | Franz Schubert; Werner Güra, Christoph Berner | | 1 |
| 2013 | Mörike-Lieder | Wolf; Werner Güra, Jan Schultsz | | 1 |
| 2013 | Licht und Liebe | Franz Schubert; Christoph Berner, Marlis Petersen, Anke Vondung, Werner Güra & Konrad Jarnot | | 1 |
| 2013 | Matthäus-Passion BWV 244 | Bach; Sunhae Im, Bernarda Fink, Werner Güra, Topi Lehtipuu, Johannes Weisser, Konstantin Wolff, RIAS Kammerchor, Staats‐ und Domchor Berlin, Akademie für Alte Musik Berlin, René Jacobs | 5 | 3 |
| 2014 | Requiem | Mozart; Insula Orchestra, Accentus, Laurence Équilbey, Sandrine Piau, Sara Mingardo, Werner Güra, Christopher Purves | | 3 |
| 2015 | Lieder & Bagatellen | Ludwig van Beethoven; Werner Güra, Christoph Berner | | 1 |
| 2016 | Les Saisons | Haydn; Genia Kühmeier, Werner Güra, Christian Gerhaher, Arnold Schoenberg Chor, Concentus Musicus Wien, Nikolaus Harnoncourt | | 1 |
| 2020 | Symphony no. 9 “Choral” / Choral Fantasy in C minor, op. 80 | Beethoven; Pablo Heras‐Casado, Karg, Harmsen, Güra, Boesch, Bezuidenhout, Freiburger Barockorchester, Zürcher Sing-Akademie | | 2 |
| 2022 | Die Jahreszeiten | Joseph Haydn; Ilse Eerens, Werner Güra, André Morsch, Orpheus Vokalensemble, Concerto Köln Academy, Marcus Creed | | 1 |
| 2023 | Johannes-Passion | Bach; Werner Güra, Gli Angeli Genève, Stephan MacLeod | | 1 |
| — | Orpheus | G. P. Telemann; Roman Trekel, Dorothea Röschmann, Ruth Ziesak, Werner Güra, RIAS-Kammerchor, Akademie für Alte Musik Berlin, René Jacobs | | 1 |
