| Bryyo | | | | | | | |
| Metroid Hive (Metroid Appear) | | | | | | | |
| Surface of SR388 | | | | Song | | | |
| Tension | | | | | | | |
| Title Screen | | | | | | | |
| Torvus Bog | | | | | | | |
| VS. Metroid Queen | | | | Song | | | |
| VS.スペースパイレーツ | | | | | | | |
| アイスバレイ | | | | | | | |
| アイテム取得ジングル | | | | | | | |
| エンディング | | | | Song | | | |
| エンディング | | | | Song | | | |
| オープニング （絶滅した科学アカデミー研究所） | | | | | | | |
| クレイド部屋 | | | | Song | | | |
| クレテリア 宇宙海賊出現 | | | | Song | | | |
| スーパーメトロイドのテーマ | | | | | | | |
| スペースパイレーツ(ラボラトリーゲート) | | | | | | | |
| ゼーベタイト | | | | Song | | | |
| セクター1(SRX)SR388再現エリア | | | | | | | |
| セクター4(AQA)水中エリア | | | | | | | |
| ターロンオーバーワールド | | | | | | | |
| タイトル | | | | | | | |
| タイトル | | | | Song | | | |
| ツーリアン | | | | Song | | | |
| ノルフェア 古代遺跡エリア | | | | | | | |
| ノルフェリア エリア | | | | Song | | | |
| ブリンスタ | | | | Song | | | |
| ブリンスタ 植物密生エリア | | | | | | | |
| ブリンスタ 赤土湿地エリア | | | | | | | |
| マザーブレイン | | | | Song | | | |
| マリーティア 岩の地下水エリア | | | | Song | | | |
| マリーディア 流砂の地下水エリア | | | | Song | | | |
| メニューセレクト | | | | | | | |
| リドリー部屋 | | | | Song | | | |
| 墜落船フリゲートオルフェオン | | | | Song | | | |
| 大ボス対決BGM （クレイド，クロコマイアー，ファントゥーン） | | | | Song | | | |
| 大ボス対決BGM （リドリー，ドレイゴン） | | | | Song | | | |
| 宇宙戦士 サムス アランのテーマ | | | | | | | |
| 小ボス対決BGM （スポアスポーン，ボツーン） | | | | | | | |
| 惑星ターロンIV | | | | | | | |
| 登場ファンファーレ | | | | Incidental music | | | |
| 脱出 | | | | Song | | | |
| 静寂 | | | | Song | | | |
