| 1995 | Symphony no. 3 "The Sea" / Violin Concerto no. 2 | Kalervo Tuukkanen; Jyväskylä Symphony Orchestra, Ari Rasilainen, Jaakko Kuusisto | | 1 |
| 1996 | Violin Concerto, op. 47 / Finlandia, op. 26 | Jean Sibelius; Sibelius Academy Symphony Orchestra, Eri Klas, Jaakko Kuusisto | | 1 |
| 1998 | Complete Works for Violin, Cello, Double Bass and Piano | Aulis Sallinen; Jaakko Kuusisto, Mats Rondin, Saara Hakkila, Ilkka Paananen | | 1 |
| 1999 | Complete Youth Production for Violin and Piano, Volume 1 | Jean Sibelius; Jaakko Kuusisto, Folke Gräsbeck | | 1 |
| 1999 | Double Bow | Prokofiev; Jaakko Kuusisto, Pekka Kuusisto | | 1 |
| 2000 | Complete Youth Production for Violin and Piano, Volume 2 | Jean Sibelius; Jaakko Kuusisto, Folke Gräsbeck | | 1 |
| 2001 | Triple Concerto / Petite Suite / Nonets 1 & 2 | Olli Mustonen; Pekka Kuusisto, Jaakko Kuusisto, Elisabeth Batiashvili, Martti Rousi, Tapiola Sinfonietta, Olli Mustonen | | 1 |
| 2001 | Violin Concertos | Johann Sebastian Bach; Tapiola Sinfonietta, Jaakko Kuusisto, Pekka Kuusisto | | 1 |
| 2001 | Complete Works for Violin and Orchestra | Sibelius; Miriam Fried, Jaakko Kuusisto, Leonidas Kavakos, Helsinki Philharmonic, Okko Kamu | | 2 |
| 2001 | The 7 Seasons | Antonio Vivaldi, Jaakko Kuusisto; Réka Szilvay, The Helsinki Strings, Csaba Szilvay, Géza Szilvay | | 1 |
| 2002 | Music! | Trio Töykeät, Jaakko Kuusisto, Pekka Kuusisto, The Lahti Symphony Orchestra, Osmo Vänskä | | 1 |
| 2003 | Aho: Symphony no. 3 / Mussorgsky/Aho: Songs & Dances of Death | Kalevi Aho; Lahti Symphony Orchestra, Osmo Vänskä, Matti Salminen, Jaakko Kuusisto | | 2 |
| 2003 | Complete Piano Trios, Volume 1 | Jean Sibelius; Jaakko Kuusisto, Satu Vänskä, Marko Ylönen, Folke Gräsbeck | | 1 |
| 2003 | Violin Sonatas / Double Sonata | Prokofiev; Jaakko & Pekka Kuusisto, Ilkka Paananen, Raija Kerppo | 5 | 1 |
| 2004 | Complete Piano Trios, Volume 2 | Jean Sibelius; Jaakko Kuusisto, Marko Ylönen, Folke Gräsbeck | | 1 |
| 2004 | The Journey: Symphony no. 8 / Violin Concerto | Einojuhani Rautavaara; Sinfonia Lahti, Osmo Vänskä, Jaakko Kuusisto | | 1 |
| 2005 | Complete Piano Quartets | Jean Sibelius; Jaakko Kuusisto, Satu Vänskä, Taneli Turunen, Folke Gräsbeck, Peter Lönnqvist, Harri Viitanen | | 2 |
| 2007 | Enchanted Garden: Orchestral Works by Uljas Pulkkis | Uljas Pulkkis; Sharon Bezaly, Jaakko Kuusisto, Stavanger Symphony Orchestra, Susanna Mälkki | | 1 |
| 2009 | Täällä Pohjantähden alla: soundtrack | Jaakko Kuusisto; Sinfonia Lahti | | 1 |
| 2010 | Symphonic Fantasy / Berceuse / Serenade / Suite in E-flat major | Armas Järnefelt; Lahti Symphony Orchestra, Jaakko Kuusisto | | 1 |
| 2011 | Orchestral Works | Ilkka Kuusisto; Pekka Kuusisto, Lahti Symphony Orchestra, Jaakko Kuusisto | | 1 |
| 2013 | The Red Violin: Concertos by Corigliano & Kuusisto | John Corigliano, Jaakko Kuusisto; Elina Vähälä, Sinfonia Lahti, Jaakko Kuusisto | | 2 |
| 2013 | Masonic Ritual Music | Jean Sibelius; Hannu Jurmu, Harri Viitanen, YL Male Voice Choir, Mika Pohjonen, Lahti Symphony Orchestra, Jaakko Kuusisto | | 2 |
| 2013 | Symphony 8 / Violin Concerto | Aulis Sallinen; Jaakko Kuusisto, Staatsphilharmonie Rheinland-Pfalz, Ari Rasilainen | | 1 |
| 2016 | Glow | Jaakko Kuusisto; Meta4, Riitta-Liisa Ristiluoma, Jan-Erik Gustafsson, Paavali Jumppanen, Heini Kärkkäinen | | 1 |
| 2018 | Entropia | Lauri Porra; Lahti Symphony Orchestra, Paperi T, Jaakko Kuusisto | | 2 |
| 2019 | Song of the Scarlet Flower (Full Score to the 1919 Film) | Armas Järnefelt; Gävle Symphony Orchestra, Jaakko Kuusisto | | 1 |
| 2021 | Kaiken maailman kehtolauluja | Ismo Alanko, Oulu Sinfonia, Jaakko Kuusisto | | 1 |
