| Symphonies nos. 1 and 2 / Le Poème du Rhône | Maurice Emmanuel; Rhenish Philharmonic Orchestra, Leif Segerstam, Gilles Nopre | CD | 10 | | Marco Polo | 8.223507 | 4891030235076 |
| Symphonies n° 1 et 2 / Le Poème du Rhône | Maurice Emmanuel; Orchestre Philharmonique de Rhénanie-Palatinat, Leif Segerstam, Gilles Nopre | CD | 10 | | Naxos Patrimoine | 8.550889 | 4891030508897 |
| Songs of Burgundy | Maurice Emmanuel; Florence Katz, Jean-Pierre Quenaudon, Laure Rivierre, Choeur Régional de Bourgogne, Roger Toulet | CD | 30 | | Marco Polo | 8.223891 | 730099389129 |
| Canteloube: Chants d'Auvergne / Emmanuel: Chansons bourguignonnes | Canteloube, Emmanuel; Dawn Upshaw, Kent Nagano, Orchestre de l’Opéra National de Lyon | CD | 24 | | Erato | 0630-17577-2 | 706301757727 |
| en miroir: Dans un caractère populaire | Georges Enesco, Maurice Ravel, Maurice Emmanuel, Fritz Kreisler; Patrick Bismuth, Anne Gaels | 2×CD | 13 + 14 | | Zig-Zag Territoires | ZZT010801 | 3760009290129 |
| Les Six Sonatines / Sonate pour clarinette, flûte et piano | Maurice Emmanuel; Marie-Catherine Girod, Alain Marion, Richard Vieille | CD | 25 | | Accord | 476 165 8 | 028947616580 |
| Les symphonies / Suite Française / Ouverture pour un conte gai | Maurice Emmanuel; Orchestre philharmonique slovène, Emmanuel Villaume | Digital Media | 14 | | Timpani | 1C1189 | |
| Les 6 sonatines | Maurice Emmanuel; Laurent Wagschal | CD | 22 | | Timpani | 1C1194 | 3377891311940 |
| Music for Flute, Clarinet and Piano | Charles Koechlin, Maurice Emmanuel; Markus Brönnimann, Jean-Philippe Vivier, Michael Kleiser | CD | 21 | | Brilliant Classics | 9422 | 5029365942225 |
| Trente chansons bourguignonnes du pays de Beaune | Maurice Emmanuel; Choeur Régional de Bourgogne, Roger Toulet, Florence Katz, Jean-Pierre Quenaudon, Laure Rivierre | CD | 30 | | Naxos Patrimoine | 8.553713 | |
