| 1989 | Contemporary Music for Cello and Piano | Anssi Karttunen, Tuija Hakkila | | 1 |
| 1990 | Debussy / Enescu / Janáček / Kodály | Debussy, Enescu, Janáček, Kodály; Tuija Hakkila, Anssi Karttunen | | 1 |
| 1993 | Du Cristal / …À La Fumée / Nymphéa | Kaija Saariaho; Los Angeles Philharmonic, Esa-Pekka Salonen, Petri Alanko, Anssi Karttunen, Kronos Quartet | | 2 |
| 1994 | Complete Works for Cello and Fortepiano, Vol. 1 | Ludwig van Beethoven; Anssi Karttunen, Tuija Hakkila | | 2 |
| 1995 | Complete Works for Cello and Fortepiano, Vol. 2 | Ludwig van Beethoven; Anssi Karttunen, Tuija Hakkila | | 3 |
| 1996 | Complete Works for Cello and Fortepiano, Vol. 3 | Ludwig van Beethoven; Anssi Karttunen, Tuija Hakkila | | 2 |
| 1997 | Private Gardens | Kaija Saariaho; Camilla Hoitenga, Florent Jodelet, Anssi Karttunen, Dawn Upshaw | | 1 |
| 2001 | Château de l'âme / Graal théâtre / Amers | Kaija Saariaho; Dawn Upshaw, Gidon Kremer, Anssi Karttunen, Esa-Pekka Salonen | | 1 |
| 2001 | LA Variations / Five Images after Sappho / Mania / Gambit / Giro | Esa-Pekka Salonen; Dawn Upshaw, Anssi Karttunen, Los Angeles Philharmonic, London Sinfonietta, Esa-Pekka Salonen | | 1 |
| 2002 | Clarinet Quintet / loco / Capriole | Kimmo Hakola; Kari Kriikku, Avanti! Quartet, Anssi Karttunen | | 1 |
| 2007 | A Due | Bergman, Hakola, Heininen, Jokinen, Kortekangas, Lindberg, Länsiö, Meriläinen, Saariaho, Tiensuu; Kari Kriikku, Anssi Karttunen | | 1 |
| 2008 | Notes on Light / Orion / Mirage | Kaija Saariaho; Karita Mattila, Anssi Karttunen, Orchestre de Paris, Christoph Eschenbach | | 1 |
| 2012 | Brahms by Arrangement, Volume One: String Quintet in F minor / String Quintet in B minor | Brahms, Anssi Karttunen; Zebra Trio, Krysia Osostowicz, James Boyd, Richard Lester | | 1 |
| 2012 | Chamber Works | Magnus Lindberg; Kari Kriikku, Anssi Karttunen, Magnus Lindberg | | 1 |
| 2012 | Trios | Kaija Saariaho; Steven Dann, Pia Freund, Tuija Hakkila, Florent Jodelet, Anssi Karttunen, Ernst Kovacic | | 1 |
| 2013 | Correspondances | Henri Dutilleux; Barbara Hannigan, Anssi Karttunen, Orchestre philharmonique de Radio France, Esa-Pekka Salonen | 4 | 2 |
| 2014 | Orchestral Works • 1 | Toshio Hosokawa; Stefan Dohr, Momo Kodama, Anssi Karttunen, Royal Scottish National Orchestra, Jun Märkl | | 1 |
| 2015 | Let the Wind Speak | Kaija Saariaho; Camilla Hoitenga, Anssi Karttunen, Daniel Belcher, Héloïse Dautry, Da Camera of Houston | | 1 |
| 2016 | Al Largo / Cello Concerto No. 2 / Era | Magnus Lindberg; Anssi Karttunen, Finnish Radio Symphony Orchestra, Hannu Lintu | | 1 |
| 2019 | Heliogabalus imperator / Works for orchestra | Hans Werner Henze; Anssi Karttunen, Oliver Knussen, BBC Symphony Orchestra | | 1 |
| 2020 | Songs of Love and Sorrow / The Six Realms | Peter Lieberson; Gerald Finley, Anssi Karttunen, Finnish Radio Symphony Orchestra, Hannu Lintu | | 1 |
