| 1989 | Rautavaara: Cantos / Die Liebenden / Heiniö: Genom kvällen | Rautavaara, Heiniö; City of Espoo Chamber Orchestra, Juhani Lamminmäki, Soile Isokoski, Liisa Pohjola, Tapiola Chamber Choir | | 1 |
| 1989 | The Celebrated Soprano | Sibelius, Rangström, Kuula, Grieg; Soile Isokoski, Marita Viitasalo | | 2 |
| 1991 | Symphony no. 3 / Opus sonorum / Requiem | Joonas Kokkonen; Soile Isokoski, Walton Grönroos, Savonlinna Opera Festical Choir, Lahti Symphony Orchestra, Ulf Söderblom | | 1 |
| 1993 | Lieder | Franz Schubert; Soile Isokoski, Marita Viitasalo | | 2 |
| 1995 | Kullervo | Jean Sibelius; Soile Isokoski, Raimo Laukka, The Danish National Radio Symphony, Danish National Radio Choir, Leif Segerstam | | 1 |
| 1996 | Finlandia / Luonnotar / Karelia Suite / Oceanides / King Christian | Sibelius; Gothenburg Symphony Orchestra, Neeme Järvi, Soile Isokoski | | 1 |
| 1999 | Conferment Cantata / Coronation Cantata / Academic March / Andante Festivo / Finlandia | Jean Sibelius; Soile Isokoski, Jaakko Kortekangas, Helsinki Philharmonic Orchestra, Finnish Philharmonic Choir, Leif Segerstam | | 1 |
| 2000 | Suomeni suloksi | Soile Isokoski, Marita Viitasalo | | 1 |
| 2001 | Missa solemnis / Tantum ergo | Franz Schubert; Isokoski, Groop, Ullmann, Kotilainen, Peter Schreier -kuoro, Tapiola Sinfonietta, Peter Schreier | | 1 |
| 2002 | Italienisches Liederbuch | Hugo Wolf; Soile Isokoski, Bo Skovhus, Marita Viitasalo | | 1 |
| 2002 | Lyrische Symphonie / Orchestral Preludes and Interludes | Zemlinsky; Soile Isokoski, Bo Skovhus, Gürzenich-Orchester Kölner Philharmoniker, James Conlon | | 1 |
| 2002 | Orchestral Songs / Vier letzte Lieder | Richard Strauss; Soile Isokoski, Rundfunk-Sinfonieorchester Berlin, Marek Janowski | | 1 |
| 2003 | Suomalainen rukous | Soile Isokoski, Helsingin kaupunginorkesteri, John Storgårds | | 2 |
| 2003 | Die Loreley | Pacius; Soile Isokoski, Raimo Sirkiä, Cornelius Hauptmann, Dominante, Lahti Symphony Orchestra & Osmo Vänskä | | 1 |
| 2005 | Jumalaa kiittää sieluni • Hymns in Finnish | Soile Isokoski • Marita Viitasalo | | 1 |
| 2006 | Luonnotar / Orchestral Songs | Sibelius; Soile Isokoski, Helsinki Philharmonic Orchestra, Leif Segerstam | | 2 |
| 2006 | Jouluyö, juhlayö | Soile Isokoski, Ylioppilaskunnan Laulajat, Matti Hyökki | | 2 |
| 2007 | Soile Isokoski laulaa virsiä 2: Oi nimi kaikkein suloisin | Soile Isokoski, Marita Viitasalo | | 2 |
| 2007 | Joulun tähtihetkiä | Soile Isokoski, Finlandia Sinfonietta, Ilkka Kuusisto | | 1 |
| 2008 | Kullervo | Sibelius; Soile Isokoski, Tommi Hakala, YL Male Voice Choir, Helsinki Philharmonic Orchestra, Leif Segerstam | | 2 |
| 2014 | Monna Vanna (Act I) / Songs | Rachmaninov; Moscow Conservatory Opera Soloists, Students Choir and Symphony Orchestra, Soile Isokoski, Vladimir Ashkenazy | | 1 |
| 2014 | Oi Jouluyö: Christmas Carols | Soile Isokoski, Lapin kamariorkesteri, John Storgårds | | 1 |
| 2015 | Chausson: Poème de l’amour et de la mer / Berlioz: Nuits d’été / Duparc: Songs | Chausson, Berlioz, Duparc; Soile Isokoski, Helsinki Philharmonic Orchestra, John Storgårds | | 1 |
| 2016 | Traumgesicht / Marjatta / The Blue Pearl | Erkki Melartin; Soile Isokoski, Finnish Radio Symphony Orchestra, Hannu Lintu | | 1 |
