| 1954 | Bonporti: Concerto in Re maggiore, op. 11 no. 8 / Concerto in Si bemolle maggiore, op. 11 no. 3 / Vivaldi: Concerto in Do maggiore, F. V no. 1 / Concerto d’orchestra in Sol minore | Francesco Antonio Bonporti, Antonio Vivaldi; Orchestra dell'Angelicum di Milano, Aladar Janes | | 1 |
| 1966 | L’adagio d’ Albinoni et Venise | T. Albinoni, F. Bonporti, A. Vivaldi; Orchestre de chambre Jean‐François Paillard | | 1 |
| 1967 | Albinoni: Two Oboe Concertos / Bonporti: Concerto a quattro / Geminiani: Concerto grosso | Albinoni, Bonporti, Geminiani; I Musici | | 2 |
| 1971 | 4 Concerti a quattro | Bonporti; Roberto Michelucci, Francesco Strano, I Musici | | 1 |
| 1983 | Invenzioni, opus X nos. 1-5 | Bonporti; Roger Elmiger, Micheline Mitrani | | 1 |
| 1989 | Celebrated Baroque Pieces | Albinoni, Bach, Händel, Vivaldi, Bonporti, Galuppi, Geminiani; I Solisti Italiani | | 5 |
| 1991 | Concertini e serenate, a violino e violoncello, o cembalo | Francesco Antonio Bonporti; Luigi Mangiocavallo, Claudio Ronco, Marco Mencoboni | | 2 |
| 1993 | Violin Concertos by Bach, Bonporti & Vivaldi | Bach, Bonporti, Vivaldi; Collegium Musicum 90, Simon Standage | | 1 |
| 1997 | Invenzioni a violino solo | Bonporti; Chiara Banchini, Jesper Christensen, Gaetano Nasillo | | 2 |
| 1998 | Motets | Bonporti; Ellen Hargis, Ensemble Ouabache | | 1 |
| 2000 | Bonporti Edition, Vol. 1: Motetti, op. 3 | Bonporti; Accademia I Filarmonici, Alberto Martini, Gemma Bertagnolli | | 1 |
| 2001 | Bonporti Edition, Vol. 2: Sonate da Camera (1703) | Bonporti; Accademia I Filarmonici, Alberto Martini | | 1 |
| 2002 | Bonporti Edition, Vol. 3: Concerti a Quattro per violino, archi e basso continuo, op. 11 | Bonporti; Accademia I Filarmonici, Alberto Martini | | 1 |
| 2003 | Bonporti Edition, Vol. 4: Invenzioni, op. 10 / Sonate, op. 7 | Bonporti; Accademia I Filarmonici, Alberto Martini | | 1 |
| 2004 | Bonporti Edition, Vol. 5: Sonate, op. 4 / Sonate, op. 6 | Bonporti; Accademia I Filarmonici, Alberto Martini | | 1 |
| 2013 | Devil’s Trill | Veracini, Tartini, Bonporti; Enrico Onofri, Imaginarium Ensemble | | 2 |
| 2018 | Sonatas, op. 2 for 2 Violins and B.C. | Bonporti; Labirinti Armonici | | 2 |
| 2020 | Bonporti: Sonatas, op. 1 for 2 Violins and B.C. | Bonporti; Labirinti Armonici | | 2 |
| 2022 | The Habsburg Garden of Eden | Caldara, Bonporti, Handel, Biber, Ziani, Muffat; Ensemble Arava | | 1 |
