| Schubert’s Winterreise: A Composed Interpretation | Hans Zender; Hans Peter Blochwitz, Ensemble Modern | 2×CD | 13 + 11 | | RCA Victor Red Seal | 09026 68067 2 | 090266806720 |
| "...zwei Gefühle...", Musik mit Leonardo / Notturno / Interieur I | Helmut Lachenmann; Helmut Lachenmann, Andreas Lindenbaum, Björn Wilker, Ensemble Klangforum Wien, Hans Zender | CD | 3 | | Accord | 204852 | 3229262048521 |
| Canti di prigionia / Cinque frammenti di Saffo | Luigi Dallapiccola; New London Chamber Choir, James Wood, Ensemble intercontemporain, Hans Zender | CD | 20 | | Erato | 4509-98509-2 | 745099850920 |
| Antiphonen / Omnia tempus habent / Présence | Bernd Alois Zimmermann; Tabea Zimmermann, Ensemble Modern, Hans Zender | CD | 11 | | RCA Victor Red Seal | 09026 61181 2 | 090266118120 |
| Symphonies 1 & 6 / Violin Concerto | Beethoven; Henryk Szeryng, Rundfunk‐Sinfonieorchester Saarbrücken, Hans Zender | 2×CD | 9 + 3 | | Classic Produktion Osnabrück | 999 474-2 | 761203947423 |
| Symphony no. 6 | Mahler; Rundfunk‐Sinfonieorchester Saarbrücken, Hans Zender | CD | 4 | | Classic Produktion Osnabrück | 999 477-2 | |
| Symphony no. 7 | Gustav Mahler; Rundfunk‐Sinfonieorchester Saarbrücken, Hans Zender | CD | 5 | | Classic Produktion Osnabrück | 999 478-2 | 761203947829 |
| Symphony no. 9 / Des Knaben Wunderhorn | Mahler; Brigitte Fassbaender, Dietrich Fischer‐Dieskau, Rundfunk-Sinfonieorchester Saarbrücken, Hans Zender | 2×CD | 4 + 11 | | Classic Produktion Osnabrück | 999 479-2 | 761203947928 |
| Cello Concerto / Impromptu / Antiphonen / Photoptosis | Zimmermann; Siegfried Palm, Eckart Schloifer, Rundfunk‐Sinfonieorchester Saarbrücken, Hans Zender | CD | 12 | | Classic Produktion Osnabrück | 999 482-2 | 761203948222 |
| Piano and Orchestra / Flute and Orchestra / Oboe and Orchestra / Cello and Orchestra | Feldman; Rundfunk‐Sinfonieorchester Saarbrücken, Hans Zender | 2×CD | 2 + 2 | | Classic Produktion Osnabrück | 999 483-2 | 761203948321 |
| Yamaon / Anahit / I presagi / Tre pezzi / Okanagon | Giacinto Scelsi; Klangforum Wien, Hans Zender | CD | 11 | | KAIROS | 0012032KAI | 782124120320 |
| Natura renovatur | Giacinto Scelsi; Klangforum Wien, Hans Zender | CD | 7 | | KAIROS | 0012162KAI | 782124121624 |
| Music to Hear / Litanei / Muji no kyō / Fūrin no kyō | Hans Zender; Klangforum Wien, Hans Zender | CD | 4 | | KAIROS | 0012262KAI | 782124122621 |
| Canti di prigionia / Cinque frammenti di Saffo | Dallapiccola; New London Chamber Choir, James Wood, Ensemble InterContemporain, Hans Zender | CD | 20 | | Apex | 8573 89230 2 | 685738923021 |
| Concerto for Violoncello and Orchestra / Sonata for Oboe, Harp and Viola | Isang Yun; Siegfried Palm, Heinz Holliger, Hans Zender, Berlin Radio Symphony Orchestra | CD | 2 | | Camerata Tokyo Inc. | CM-22 | 4990355000229 |
| The Complete Symphonies nos. 1-8 | Franz Schubert; SWR Sinfonieorchester Baden-Baden und Freiburg, Hans Zender | 4×CD | 8 + 8 + 8 + 6 | | Hänssler Classic | 15RC | 4010276014669 |
| Musik für Oboe und Orchester / Styx und Lethe / Dritte Musik / Erster Doppelgesang | Wolfgang Rihm; SWR Sinfonieorchester Baden-Baden und Freiburg, Hans Zender, Michael Gielen, Jan Latham-Koenig | CD | 4 | | Hänssler Classic | 93.185 | 4010276018698 |
| Schuberts Winterreise | Hans Zender; Julian Prégardien, Deutsche Radio Philharmonie, Robert Reimer | CD | 24 | | Alpha Classics | ALPHA 425 | 3760014194252 |
| Schuberts "Winterreise": eine komponierte Interpretation | Hans Zender; Christoph Prégardien, Klangforum Wien, Sylvain Cambreling | 2×CD | 16 + 8 | | KAIROS | 0012002KAI | 782124120023 |
