| 1982 | Lute Suites nos. 2 & 4 | Bach; Manuel Barrueco | | 1 |
| 1989 | Manuel Barrueco Plays Brouwer, Villa-Lobos & Orbón | Brouwer, Villa-Lobos, Orbón; Manuel Barrueco | | 1 |
| 1990 | Mozart: Duets for Flute & Guitar | Wolfgang Amadeus Mozart; Ransom Wilson, Manuel Barrueco | | 1 |
| 1992 | Manel Barrueco Spielt/Plays/Joue Albeniz & Turina | Manuel Barrueco | | 1 |
| 1994 | Manuel Barrueco Plays Lennon & McCartney | Manuel Barrueco | | 1 |
| 1994 | Sometime Ago | Manuel Barrueco | | 1 |
| 1997 | Bach & de Visée | Bach, de Visée; Manuel Barrueco | | 1 |
| 1997 | Manuel Barrueco Plays Albéniz & Turina | Manuel Barrueco | | 1 |
| 1997 | Concierto de Aranjuez / Fantasía para un gentilhombre | Rodrigo; Manuel Barrueco, Plácido Domingo, Philharmonia Orchestra | | 3 |
| 1997 | J.S. Bach Sonatas, arr. Barrueco | Manuel Barrueco | | 1 |
| 1997 | J.S. Bach Sonatas | J.S. Bach; Manuel Barrueco | | 1 |
| 1997 | Mozart & Sor | Mozart, Sor; Manuel Barrueco | | 1 |
| 1997 | Sonatas | Johann Sebastian Bach; Manuel Barrueco | | 1 |
| 1998 | Cantos y danzas | Brouwer, Mangoré, Ponce, Villa‐Lobos, Gnattali, Grenet, Lauro, Piazzolla; Manuel Barrueco, Barbara Hendricks, Emmanuel Pahud | | 1 |
| 1999 | ¡Cuba! | Manuel Barrueco | | 1 |
| 2001 | Nylon & Steel | Manuel Barrueco | | 2 |
| 2005 | Concierto barroco | Manuel Barrueco, Víctor Pablo Pérez, Orquesta Sinfónica de Galicia | | 1 |
| 2007 | Solo Piazzolla | Manuel Barrueco | | 1 |
| 2008 | Tango Sensations: Music of Piazzolla & Guastavino | Manuel Barrueco & Cuarteto Latinoamericano | | 1 |
| 2010 | Tarrega! | Manuel Barrueco | | 1 |
| 2012 | Chaconne ~ A Baroque Recital | Manuel Barrueco | | 1 |
| 2017 | Fernando Sor: The Beethoven of the Guitar | Manuel Barrueco | | 1 |
| 2019 | Guitar Concerto / Harmonica Concerto / Sexteto místico / Quinteto instrumental | Heitor Villa‐Lobos; Manuel Barrueco, José Staneck, São Paulo Symphony Orchestra, Giancarlo Guerrero | | 1 |
| — | Falla: 7 canciones populares españolas / Granados: 12 danzas españolas | Falla, Granados; Manuel Barrueco | | 1 |
| — | Favorites for Classical Guitar | Manuel Barrueco | | 1 |
| — | Manuel Barrueco Plays de Falla, Ponce, Rodrigo | de Falla, Ponce, Rodrigo; Manuel Barrueco | | 1 |
